临床主要用于治疗遗精、膀胱癌、糖尿病肾病等病症。
1.遗精(经验)：以水陆二仙丹合知柏地黄丸，治疗由神经衰弱、前列腺炎、精囊炎等引起的遗精，属于肾阴亏虚，症见头晕目眩、耳鸣腰酸、神疲乏力、形体瘦弱、舌红少津、脉来弦细带数者，有一定疗效。(《实用中医内科学》上海科学技术出版社)
2.膀胱癌(经验)：以本方合补中益气汤加减，治疗膀胱癌证属脾肾气虚，见尿血、排尿不畅、淋沥不尽、神疲乏力、少气懒言、动辄气短、舌淡有齿痕、脉象沉缓者，有一定疗效。(《实用中医内科学》上海科学技术出版社)
3.糖尿病肾病：在糖尿病肾病的分期中糖尿病肾病(Ⅲ期)是一个关键期，是治疗的最佳阶段。运用左归饮加水陆二仙丹对40例早期糖尿病肾病进行干预治疗，取得满意疗效。(《第五届全国中西医结合内分泌代谢病学术大会暨糖尿病论坛论文集》2012年)
4.前列腺炎、早泄(经验)：徐福松教授运用水陆二仙丹治疗前列腺炎及早泄取得了较好的疗效。(《浙江中医药大学学报》2010年第4期)